Activités actuelles de la PDMPP

Phénotypage d'iPSC et édition génomique par la technologie CRISPR-Cas9

Les iPSC sont au cœur de la recherche à la PDMPP

Ce groupe de travail est chargé de caractériser des lignées d’iPSC fournies par la PDMPP  afin que nos projets de recherche utilisent uniquement des iPSC de grande qualité. De nouvelles lignées, génétiquement modifiées par la technologie CRISPR, s’ajoutent régulièrement au catalogue de la PDMPP.

Phénotypage d'iPSC

• Optimisation de milieu de croissance et de réactifs de repiquage

• Tests de contrôle de la qualité: intégrité des chromosomes, caractéristiques morphologiques, expression de marqueurs de pluripotence, dépistage microbiologique/viral.

Édition génomique par technologie CRISPR-Cas9

• Insertion et délétion de gènes dans des lignées cellulaires de contrôle

• Correction de mutations associées à une maladie dans des lignées provenant de patients

Validation d’anticorps et de gènes excisés par CRISPR

• Production de lignées de gènes excisés (knock-out) pour développer et valider des anticorps commerciaux (ALS Reproducible Antibody Platform [ALS-RAP]) - partenariat avec une société de validation d'anticorps YCharOS.

Découverte et profilage de nouveaux médicaments

L’automatisation fait avancer la recherche à la PDMPP

Disposant de technologies de pointe, ce groupe de travail adapte les tests développés à partir d'iPSC en formats de criblages 2D et 3D.

Acquisition et analyse automatisées d’images

• Optimisation d’analyses basées sur l’immunofluorescence

• Flux opérationnel établi pour la gestion de données

• Logiciel en libre accès, conçu à l’interne pour améliorer l’analyse de données.

L’attention est mise sur diverses maladies et processus :

• Maladie de Parkinson et autres synucléinopathies

• Maladies neuromusculaires

• Maladies neurodéveloppementales

• Neuroimmunité et Neuroinflammation

Organoïdes cérébraux et génie tissulaire

Les organoïdes cérébraux changent notre perspective sur le cerveau humain. 

Le passage de neurones issus d'iPSC d’un modèle bidimensionnel à tridimensionnel a permis à ce groupe de travail de créer le programme de cerveaux miniatures de la PDMPP. L’équipe a recours à de multiples approches pour caractériser des modèles organoïdes 3D, tout en explorant des systèmes novateurs de culture en 3D.

Développement de modèles 3D

• Multiples types de tissus : prosencéphale, mésencéphale, cérébral

• Lots adaptables en fonction des besoins : en nombre (de 100 à 700) et en âge (de 15 jours à + de 100 jours)

Histologie et imagerie 3D

• Immunohistochimie et microscopie à fluorescence 

• Inclusion à la paraffine et microtomie

• Spécimens clarifiés par la méthode Cubic

• Méthodes d'imagerie 3D automatisée sur Opera Phenix HC

Maintient d’organoïdes en culture et contrôle de la qualité

• Incubateurs spécifiques pour organoïdes pouvant contenir jusqu’à 15 000 cerveaux miniatures

• Le suivi quotidien de chaque organoïde est assuré par une équipe spécialisée, au moyen d’un système de gestion de l’information pour laboratoires (SGIL).

Phénotypage de cellules individuelles

• Le système automatisé de cytométrie en flux, Attune, qui utilise une technologie brevetée de focalisation acoustique ultramoderne, nous permet d’analyser et de caractériser les diverses cellules composant les organoïdes.

• Installation d’un système opérationnel pour séparer et individualiser les cellules composant les organoïdes afin de permettre leur analyse subséquente par séquençage ou par cytométrie en flux.

• Pipeline informatique permettant l’étude du profil d’expression de diverses cellules composant les organoïdes.

Formation et sensibilisation

Apprenez avec nous à la PDMPP

Pour plus d'informations sur les possibilités de formation à la PDMPP, veuillez visiter cette page.